MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 15277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015574	TA	3	6	196702	196707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015574	A	7	7	196707	196713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015574	CTG	2	6	197542	197547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_015574	T	7	7	197562	197568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015574	TAT	2	6	197611	197616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015574	TAAAT	2	10	197635	197644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015574	T	8	8	197650	197657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015574	AATT	2	8	197683	197690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015574	T	6	6	197713	197718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015574	GAAA	2	8	197757	197764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015574	TAA	2	6	197788	197793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015574	ACT	2	6	197853	197858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_015574	AATT	2	8	197866	197873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015574	TTGAA	2	10	197892	197901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015574	AATTA	2	10	197909	197918	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015574	TG	3	6	198826	198831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015574	ATT	2	6	198847	198852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015574	TAA	2	6	198885	198890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015574	TTA	2	6	198937	198942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015574	ATA	2	6	198989	198994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015574	ATA	2	6	199003	199008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015574	T	6	6	199042	199047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015574	AATTA	2	10	201245	201254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015574	A	7	7	201317	201323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015574	TCT	2	6	201337	201342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015574	T	7	7	201342	201348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015574	ATT	2	6	201366	201371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015574	ATT	3	9	201376	201384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015574	TAA	2	6	201394	201399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015574	AATT	2	8	201403	201410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015574	TAGA	2	8	201424	201431	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015574	ACA	2	6	201436	201441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_015574	AAAC	2	8	201464	201471	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_015574	T	7	7	201531	201537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015574	AAT	2	6	201575	201580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015574	A	7	7	201591	201597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1038	NC_015574	A	8	8	201681	201688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015574	TAC	2	6	203479	203484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1041	NC_015574	T	7	7	203599	203605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015574	AACT	2	8	203613	203620	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_015574	A	6	6	203674	203679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015574	T	6	6	203680	203685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015574	A	7	7	203770	203776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015574	GTT	2	6	203790	203795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015574	ATTTAT	2	12	203812	203823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015574	TAT	2	6	203845	203850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015574	ATA	2	6	203869	203874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015574	AT	3	6	203894	203899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015574	A	8	8	203916	203923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015574	T	8	8	204334	204341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015574	ATA	2	6	204368	204373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015574	T	6	6	204377	204382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015574	CAT	2	6	206143	206148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015574	AT	3	6	206153	206158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015574	ATT	2	6	206183	206188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015574	TA	3	6	206255	206260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015574	TAT	2	6	206285	206290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015574	TA	3	6	206413	206418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015574	CAT	2	6	206444	206449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_015574	GAAG	2	8	206479	206486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015574	ATTTT	2	10	207855	207864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015574	T	8	8	207885	207892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015574	T	7	7	207918	207924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015574	AATAA	2	10	207951	207960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015574	ATATA	2	10	207968	207977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015574	AAG	2	6	207996	208001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015574	T	6	6	208282	208287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015574	CT	3	6	208348	208353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_015574	TA	3	6	208363	208368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015574	TAG	2	6	208385	208390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015574	GTA	2	6	208435	208440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015574	CTT	2	6	209388	209393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_015574	T	7	7	209404	209410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015574	ATA	2	6	209416	209421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015574	T	7	7	209444	209450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015574	A	6	6	209471	209476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015574	TAAA	2	8	209497	209504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015574	A	7	7	209502	209508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015574	TAT	2	6	209526	209531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015574	CTC	2	6	210052	210057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_015574	TAATT	2	10	210081	210090	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015574	GATGT	2	10	210124	210133	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015574	A	7	7	210252	210258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015574	GT	3	6	212375	212380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015574	ATTC	2	8	212476	212483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_015574	A	6	6	212490	212495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015574	ATT	2	6	212497	212502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015574	ATATA	2	10	212524	212533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015574	TTTA	2	8	212537	212544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015574	A	8	8	212559	212566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015574	TA	4	8	212595	212602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015574	TAT	2	6	212654	212659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015574	ATT	2	6	212696	212701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_015574	CAA	2	6	212736	212741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_015574	GAT	2	6	212753	212758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015574	ATC	2	6	212766	212771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_015574	TTG	2	6	212778	212783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015574	TGA	2	6	212786	212791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015574	A	6	6	212821	212826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015574	A	6	6	212868	212873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015574	TAG	2	6	212876	212881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015574	AT	3	6	212917	212922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015574	TAA	2	6	213533	213538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015574	TAT	3	9	215296	215304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015574	AAATT	2	10	215331	215340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015574	ATTA	2	8	215360	215367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015574	ATT	2	6	215371	215376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015574	AAG	2	6	215387	215392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015574	TTTA	2	8	215414	215421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015574	TTGGA	2	10	218350	218359	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015574	TTTTA	2	10	218384	218393	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015574	AT	3	6	218396	218401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015574	ATTTT	2	10	218463	218472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015574	GTT	2	6	218487	218492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015574	T	7	7	218495	218501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015574	TA	3	6	218526	218531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015574	T	9	9	218544	218552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015574	CCTT	2	8	218555	218562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_015574	T	6	6	218561	218566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015574	T	6	6	218573	218578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015574	AAC	2	6	218646	218651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_015574	GTT	2	6	218698	218703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015574	AGA	2	6	218713	218718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015574	T	6	6	218719	218724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015574	T	6	6	218736	218741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015574	T	7	7	218755	218761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015574	TCA	2	6	218790	218795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_015574	GTG	2	6	218877	218882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_015574	TCT	2	6	221550	221555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_015574	TAAA	2	8	221584	221591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015574	TTTA	2	8	221603	221610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015574	GTG	2	6	221655	221660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_015574	CTTT	2	8	221671	221678	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1138	NC_015574	AAAT	2	8	222576	222583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_015574	TTA	2	6	223239	223244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1141	NC_015574	ATTT	2	8	223323	223330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1425	NC_015574	ATA	2	6	281836	281841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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